平潭综合实验区医院前身为福建省平潭县医院，是平潭目前唯一一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的公立综合性二级甲等医院。医院坐落于平潭县城关，占地面积33亩，建筑面积3.26万平方米。医院设置临床科室21个，医技科室13个，职能科室20个，床位编制550张。
平潭综合实验区医院多年来连续被评为省级文明单位，成为医保、新农合定点单位。2013年医院成为福建医科大学附属第一医院协作医院，福建医科大学、泉州医学高等专科学校的教学医院，与海峡两岸医药卫生交流协会合作建立“平潭肿瘤防治中心”。2014年医院成为福建中医药大学、福清卫校、台湾台中科技大学教学医院，海峡两岸医药卫生交流与合作基地。两年来，医院主办、承办了4场全国及省级的医疗和管理学术会议，取得良好成效。医院在人才培养、学科建设、诊疗技术、科研教学、基础设施、医院管理等方面工作均得到长足进步。2015年9月医院正式更名为平潭综合实验区医院，将促进医院更好更快发展。
平潭综合实验区医院(平潭协和医院)体检中心成立于2009年4月，是平潭岛内最早开展体检服务专业医疗机构,2018年医院成建制整合至福建医科大学附属协和医院平潭分院,9月26日健康体检中心搬迁到新院区,全面升级成健康管理中心,随着业务量不断增大,也为方便群众就近体检,2022年老院区增设健康体检中心,实现一院两区两中心为我区老百姓提供更加优质、便捷、高效的健康体检服务，新院区体检中心拥有1700余平方米宽敞明亮的体检环境，充分依托协和本部三甲医院综合实力和品牌影响,整合共享医院强大的专家资源和高精尖设备资源,秉承“服务始于主动，基于专业,终于满意”的服务理念。构建由知名专家教授组成的专业团队，引进国内先进的健康管理模式与核心技术,结合平潭地区的实际需求,以高标准、严要求、科学准确的工作作风打造有温度的现代化健康体检服务团队，立足平潭，具有区域体检品牌影响力。
